เริ่มต้นการตรวจสอบและประเมินชุดดีเอ็นเอของสุนัข

ก่อตั้งขึ้นโดยพี่น้องนักวิทยาศาสตร์หลังจากหลายปีของการศึกษาพันธุศาสตร์สุนัข Embark ($ 199) มีฐานข้อมูลที่ใหญ่ที่สุดของสายพันธุ์สุนัขของมัน มันตรวจสอบกับสุนัขมากกว่า 250 ชนิดรวมถึงหมาป่าหมาป่าหมาป่าดิงโกและที่เรียกกันว่า "สุนัขประจำหมู่บ้าน" ความกว้างของการวิเคราะห์นี้เป็นกุญแจสำคัญเมื่อมันมาถึงความถูกต้องของการกำหนดสายพันธุ์ เริ่มดำเนินการตรวจสอบ DNA ของสัตว์เลี้ยงของคุณเพื่อดูอาการของโรคทางพันธุกรรม 165 ชนิดและสามารถตัดสินได้ว่าลูกสุนัขของคุณเป็นพาหะหรือมีความเสี่ยงต่อการเป็นโรคเต็มรูปแบบ นั่นคือการทดสอบการกลายพันธุ์มากกว่าชุดทดสอบ DNA ของสุนัขอื่น ๆ เริ่มดำเนินการมีราคาแพงและอาจให้ข้อมูลมาก เกินไป แต่เป็นข้อบกพร่องเพียงอย่างเดียว

บริการคัดกรองพันธุกรรม

Embark เป็นชุด DNA สัตว์เลี้ยงที่แพงที่สุดที่ฉันทดสอบและมีให้ในชุดทดสอบเดี่ยวเท่านั้น ในช่วงเวลาของการเขียนนี้คุณจะได้รับราคาที่ดีขึ้นถ้าคุณทดสอบสุนัขหลายตัว (ใช้รหัสคูปอง "MULTIPACK" บนเว็บไซต์ของ Embark) โดยมีส่วนลดสูงสุด 20 เปอร์เซ็นต์สำหรับชุดสี่ตัวหรือมากกว่า ผู้พักอาศัยพ่อพันธุ์แม่พันธุ์และสัตวแพทย์สามารถรับส่วนลดได้ แต่เมื่อพูดไปคุณจะได้รับสิ่งที่คุณจ่ายไป คำแถลงเกี่ยวกับเว็บไซต์ของ Embark อ้างว่ากระบวนการระบุสายพันธุ์ของมัน "ทดสอบเครื่องหมายทางพันธุกรรมมากกว่า 200, 000 ตัวและสร้างโครโมโซมผสมสายพันธุ์สุนัขของคุณโดยใช้โครโมโซม"

ในระหว่างกระบวนการลงทะเบียนซึ่งคุณต้องดำเนินการก่อนที่จะส่งตัวอย่าง Embark ขอให้คุณอนุญาตให้ใช้ตัวอย่างของคุณเพื่อการวิจัย Embark ร่วมมือกับวิทยาลัยสัตวแพทยศาสตร์ Cornell University ซึ่งช่วยให้ Adam Boyko ผู้ร่วมก่อตั้งเป็นศาสตราจารย์ที่นั่นผู้วิจัยจึงมีความเป็นส่วนตัวกับข้อมูลของ Embark บริษัท จะทำงานร่วมกับนักวิจัยภายนอกที่ใช้ข้อมูลการทดสอบดีเอ็นเอเช่นพันธมิตรปัจจุบัน VetGenomics และโครงการความหลากหลายของโดเบอร์แมน

การเก็บ DNA

บรรจุภัณฑ์ของ Embark โดดเด่นเหนือคู่แข่ง ตัวอย่างเช่นฉันชอบคำแนะนำที่ชัดเจนและกระชับของชุด การ์ดด้านในแสดงคำแนะนำทั้งหมดรวมถึงแสดง URL ที่คุณสามารถเยี่ยมชมเพื่อเปิดใช้งานชุดดูรายการสายพันธุ์เรียนรู้วิธีการปัดแก้มสุนัขเพื่อรับตัวอย่างและอีกมากมาย

นอกจากนี้ยังมีแท็กสุนัขเหล็กเกรด "ขีปนาวุธ" ในแพ็คเกจซึ่งมี URL อยู่ด้านหลัง หากสุนัขของคุณสูญหายใครก็ตามพบว่าสามารถใช้ URL เพื่อเข้าถึงข้อมูลที่แชร์เกี่ยวกับสุนัขได้ หากบุคคลดังกล่าวโทรไปยังหมายเลขโทรศัพท์บนแท็ก Embark จะทำหน้าที่เป็นบุคคลที่สามเพื่อจับคู่เครื่องมือค้นหาและเจ้าของ กล่าวอีกนัยหนึ่งเริ่มดำเนินการไม่เพียง แต่จะแจกข้อมูลติดต่อส่วนตัวของคุณ

แน่นอนสิ่งแรกที่คุณทำคือเปิดใช้งานชุดเครื่องมือ - เช่นเดียวกับชุดดีเอ็นเอมนุษย์ คุณมีตัวเลือกในการใช้ Facebook หรือ Google ลงชื่อเข้าใช้หรือสร้างบัญชีด้วยที่อยู่อีเมลของคุณ หากคุณมีหลายชุดสำหรับสุนัขหลายตัวให้ลงทะเบียนชุดทั้งหมดเพื่อบัญชีเดียวกันเพื่อให้เข้าถึงออนไลน์ได้ง่าย เมื่อบัญชีของคุณใช้งานได้แล้วให้สร้างโปรไฟล์สุนัขสำหรับชุดทุกชุดที่คุณต้องการเปิดใช้งานและลงทะเบียนแต่ละชุดด้วยหมายเลขจากชุดเริ่มทำงาน

ที่นี่คุณสามารถตัดสินใจได้ว่าคุณต้องการให้ข้อมูลสุนัขของคุณมีส่วนร่วมในการวิจัยทางการแพทย์และวิทยาศาสตร์หรือไม่ (เพิ่มเติมที่ด้านล่าง) เริ่มดำเนินการแจ้งให้คุณทราบว่าจะส่งการอัปเดตทางอีเมลและหากคุณต้องการและอยู่ในสหรัฐอเมริกา ข่าวสาร

คำเตือนที่อยู่ด้านบนของแพคเกจไม่แนะนำให้คุณบดขยี้กล่องเพราะมันจะเพิ่มเป็นสองเท่าของคอนเทนเนอร์ส่งคืนสำหรับตัวอย่างดีเอ็นเอ นี่คือการทดสอบดีเอ็นเอสุนัขตัวเดียวที่ฉันเห็นว่าต้องใช้ไม้กวาดเดี่ยวส่วนที่เหลือต้องใช้ตัวอย่างสองตัวอย่าง ฟองน้ำเก็บของ Embark นั้นอยู่ที่ส่วนท้ายของภาชนะพลาสติกที่เต็มไปด้วยของเหลวที่ทรงตัว กวาดกระเป๋าของกระเป๋าที่แก้มล่างของสุนัข (ระหว่างเหงือกและแก้มโดยเฉพาะอย่างยิ่งถ้าไม่มีพวกมันจะเคี้ยว) เป็นเวลา 30 วินาที - นั่นนานกว่าการแข่งขัน 10 วินาที คลายเกลียวตัวเครื่องกลับด้านและวางฟองน้ำในของเหลว เขย่าเบา ๆ เป็นเวลา 10 วินาทีและตัวอย่างพร้อมที่จะส่งทางไปรษณีย์ เห็นได้ชัดว่าเริ่มดำเนินการโดยใช้ตัวอย่างจาก บริษัท ที่ชื่อว่า DNAGenotek ด้านล่างนี้เป็นวิดีโอคำแนะนำที่ใช้ในเว็บไซต์ของ Embark:

การทดสอบ DNA swab จากการแข่งขันนั้นเกี่ยวข้องกับการโยนสำลียาวบางส่วนในซองจดหมาย การทดสอบของ Embark นั้นให้ ความรู้สึกที่ มีเทคโนโลยีสูงและน่าเชื่อถือมากกว่าแม้ว่าจะไม่มีทางแน่ใจ นี่เป็นวิธีเดียวกับที่ใช้โดยผู้ทดสอบดีเอ็นเอมนุษย์ MyHeritage DNA ท้ายที่สุดคุณไม่สามารถพาสุนัขไปถ่มน้ำลายลงในท่ออย่างที่มนุษย์ทำกับ 23andMe

ทำตามคำแนะนำเพื่อใส่ตัวอย่างลงในซองพลาสติกที่แถมมาสอดเข้าไปในกล่องเดียวกันกับที่มันเข้ามาและปิดพนัง เปิดเข้าไปในอีเมล ฉันไปที่ห้องปฏิบัติการของ Embark ที่สำนักงานใหญ่ในบอสตัน ไปรษณีย์ทั้งหมดจ่ายล่วงหน้า

ค่าประมาณที่จะได้รับการตอบกลับจาก Embark คือสองถึงสี่สัปดาห์ ฉันได้รับการตอบกลับหนึ่งชุดใน 19 วัน ตัวอย่างที่สองปรากฏขึ้นพร้อมกับผลลัพธ์ของการผสมพันธุ์ใน 21 วัน (พร้อมอีกหนึ่งวันเพื่อให้ข้อมูลที่เหลือปรากฏขึ้น) นี่คือเวลาที่ยอดเยี่ยมในการหมุนเวียน

รายงาน DNA และคุณสมบัติพิเศษ

เริ่มดำเนินการเก็บตัวอย่างรายงานออนไลน์โดยมีสุนัข "ฮาร์เลย์ถ่ายรูปถ่ายรูป" ที่เป็นซีอีโอของฮาร์เลย์ (สุนัขคือถ่ายรูปจริง ๆ ) เมื่อตัวอย่างของคุณถูกส่งเข้าสู่ Embark จะแจ้งให้คุณทราบทางอีเมลตลอดกระบวนการ ฉันได้รับอีเมลแจ้งว่าชุดนั้นกำลังเดินทางน้อยกว่าสามชั่วโมงหลังจากที่ฉันส่งมันที่ไปรษณีย์ ฉันได้รับแจ้งถึงตัวอย่างการมาถึงที่ห้องแล็บจุดเริ่มต้นของจีโนไทป์เมื่อจีโนมนักวิทยาศาสตร์ (นักวิทยาศาสตร์ที่มีความเชี่ยวชาญด้านจีโนม) จะตรวจสอบตัวอย่างและในที่สุดอีเมลที่บอกว่าผลลัพธ์อยู่ในนั้น อัลฟ่า เพราะ Embark มีข้อตกลงกับมัน ผลลัพธ์ด้านสุขภาพบางครั้งอาจใช้เวลานานกว่าการแสดงผลการผสมพันธุ์

ซึ่งแตกต่างจากการทดสอบดีเอ็นเออื่น ๆ ที่เราทำไปแล้ว Embark วางผลลัพธ์จำนวนมากในอีเมลฉบับสุดท้ายซึ่งรวมถึงแผนภูมิโดนัทขนาดเล็กที่มีผลลัพธ์สายพันธุ์เริ่มต้นและแม้แต่คำใบ้เล็กน้อยว่า DNA หมาป่าอยู่ในสุนัขตัวเล็กของคุณ เพื่อให้ได้ผลลัพธ์เต็มคุณเข้าสู่ระบบผ่านทางเว็บไซต์ของฉันเริ่มต้น ที่นั่นคุณสามารถพิมพ์รายงาน PDF ได้แม้จะไม่ใช่ข้อมูลออนไลน์ทั้งหมดที่ปรากฏใน PDF

วิธีการของฉันคือการทดสอบสุนัขพันธุ์แท้ (Griffin) หนึ่งครั้งและดูว่า บริษัท ทดสอบจะได้รับสายพันธุ์ที่เหมาะสมหรือไม่จากนั้นทดสอบสหายพันธุ์ผสมของฉัน (Madison) สองครั้ง - ภายใต้ชื่อปลอม ("Daisy") และ บัญชีใหม่ - เพื่อดูว่าผลลัพธ์เหมือนกันทั้งสองครั้งหรือไม่ เมื่อพิจารณาถึงการทดสอบที่ได้รับจาก Embark สำหรับการใช้งานของเรามันเป็นไปได้ที่จะสามารถติดตามหมายเลขตัวอย่างที่ส่งไปยัง PCMag และจับตาดูเล่ห์เหลี่ยมดังกล่าว แต่ดูเหมือนว่าจะใช้งานได้มาก

ผลลัพธ์

จุดแรกที่คุณอาจต้องการทำในผลลัพธ์เต็มรูปแบบคือปุ่ม Breed ฉันดีใจที่ได้รายงานว่า Embark คิดว่า Griffin เป็น Golden Retriever ที่ 100.0 เปอร์เซ็นต์ซึ่งเห็นด้วยกับการตรวจ DNA อื่น ๆ ไม่กี่บวกกับเจ้าของและผู้เพาะพันธุ์ของ Griffin

แน่นอนว่าเมดิสันกลับมาพร้อมกับสายพันธุ์ทั้งหมด: 34.2 เปอร์เซ็นต์ American Pit Bull Terrier, 17.5 เปอร์เซ็นต์ Shetland Sheepdog, 13 เปอร์เซ็นต์ Labrador, 12.4 เปอร์เซ็นต์ English Springer Spaniel, 9.1 เปอร์เซ็นต์ Bull Terrier, 7.1 เปอร์เซ็นต์ German Shephard Dog (GSD) และ Rottweiler 6.7 เปอร์เซ็นต์ ไม่มีการตรวจดีเอ็นเออื่น ๆ ตรึงเธอไว้ว่ามีสปริงเกอร์หรือ GSD ในยีนของเธอ

เกิดอะไรขึ้นกับการทดสอบครั้งที่สองของ Madison (aka "Daisy")? ทุกสายพันธุ์เดียวกันอยู่ที่นั่นเพียงร้อยละแตกต่างกันเล็กน้อยในผู้ที่อยู่ตรงกลาง

เป็นที่น่าสนใจว่าสายพันธุ์ชั้นนำของเมือง Embark สำหรับ Madison คือ Pit Bull Terrier และไม่ใช่ Staff Staffshireshire Terrier โดยทั่วไปแล้วทั้งคู่จะถูกรวมเข้าด้วยกันภายใต้ชื่อเล่น "pit bull" แต่มีความแตกต่างกันอย่างน้อยก็ขนาดและรูปร่างหน้าตา American Staffordshire Terrier เป็นตัวเลือกอันดับต้น ๆ สำหรับ Madison โดยการทดสอบดีเอ็นเออื่น ๆ เช่น Wisdom Panel

ส่วนสายพันธุ์ยังให้ข้อมูลบางอย่างเกี่ยวกับตระกูลสายพันธุ์ในการแต่งหน้าของสุนัขและให้ดูที่ haplotype (ลำดับดีเอ็นเอ) สำหรับแม่และพ่อของสุนัขแม้จะแสดงแผนที่ที่บรรพบุรุษโบราณของสุนัขอาจมีต้นกำเนิด นี่คือสิ่งเล็กน้อยและบางส่วน (เช่นแผนที่) รู้สึกเหมือนเติมเพราะ

ต้นไม้ตระกูลสำหรับเมดิสันและ "เดซี่" เหมือนกัน การทดสอบจาก DNAffirm และ DNA My Dog ล้มเหลวในการคงเส้นคงวาแม้กระทั่งกับตัวเองทำให้เกิดความสงสัยในตัวพวกเขา ไม่เช่นนั้นกับเริ่มดำเนินการ มุมมองต้นไม้ครอบครัวแบ่งออกเป็นสายพันธุ์พ่อแม่พันธุ์ โปรดทราบว่ากริฟฟินไม่ได้รับต้นไม้ซึ่งเป็นเรื่องปกติเพราะมันจะเป็นทองคำทั้งหมด

สุขภาพและอื่น ๆ

อ่านหัวข้อพันธุ์ภายใต้รายการสุนัขของคุณเป็นเพียงจุดเริ่มต้น ส่วนการวิจัยต้องการงานจากคุณเจ้าของสุนัข - สำหรับผู้ที่วางแผนที่จะบริจาค DNA สุนัขให้กับวิทยาศาสตร์ เริ่มดำเนินการหวังว่าคุณจะได้กรอกแบบสำรวจเล็ก ๆ น้อย ๆ เพื่อให้การสนับสนุนนั้นคุ้มค่าในหัวข้อต่างๆเช่นสุขภาพฟันของสุนัขปัญหาพฤติกรรมและอาการแพ้และการสำรวจทางการแพทย์เต็มรูปแบบ สนุกมากอย่างที่คุณคาดหวัง: ไม่มี อย่างไรก็ตามทำถ้าคุณต้องการที่จะได้รับประสบการณ์ที่สมบูรณ์ในการทำให้โลกดีขึ้นผ่านจีโนมสุนัขของคุณ

หัวข้อสุขภาพเป็นสิ่งที่สำคัญที่สุดเนื่องจากมีผลการทดสอบทั้งหมดสำหรับการผ่าเหล่าทางพันธุกรรมที่สุนัขของคุณอาจมีหรืออย่างน้อยก็พกติดตัว ผลลัพธ์ของ Griffin นั้นชัดเจนอย่างสมบูรณ์ซึ่งเห็นด้วยกับการค้นพบจาก Wisdom Panel ผลลัพธ์ของเมดิสันก็เห็นด้วยเช่นกันเธอเป็นพาหะสำหรับความเสื่อม Myelopathy แต่จะไม่ส่งต่อต่อไปตั้งแต่เธอไม่ได้ทำอะไรเลย แม้ในขณะที่ชัดเจนส่วนนี้ยังคงแสดงเงื่อนไขทั่วไปสำหรับสายพันธุ์ของสุนัข ข้อมูลส่วนใหญ่นั้นเป็นที่สนใจของผู้ที่มีสุนัขที่มีความเสี่ยง แต่มีตัวเลือกให้อ่านทั้งหมด 165

โปรดทราบว่ารายงานของเมดิสันแสดงผลลัพธ์สำหรับการทดสอบทั้งหมด 162 ครั้งเท่านั้นไม่ใช่โฆษณา 165 รายการ ตัวแทน บริษัท กล่าวว่า "หากอัลกอริทึมของเราไม่มั่นใจ 100% ว่าจะมีการโทรเพื่อสุขภาพก็จะไม่เรียกมันว่า" หากมีการทดสอบเฉพาะที่ลูกค้าต้องการผลลัพธ์และพวกเขาไม่เห็นมันอย่าถือว่ามันเป็นค่าลบ เริ่มดำเนินการจะตรวจสอบผลลัพธ์ด้วยตนเองตามคำขอของเจ้าของสุนัข

มีลิงก์ในส่วนสุขภาพสำหรับสร้างรายงานที่ง่ายต่อการแชร์หรือพิมพ์สำหรับสัตวแพทย์ หากสุนัขพันธุ์แท้มีลิงก์สำหรับส่งรายงานการค้นพบทางพันธุกรรมไปยังมูลนิธิออร์โธพีดิกส์เพื่อสัตว์ (OFA) ซึ่งเป็นองค์กรที่ต้องการลดโรคทางพันธุกรรมในสัตว์เลี้ยง

ในที่สุดก็มีส่วนขั้นสูงเพื่อแสดงผลลัพธ์เฉพาะนักพันธุศาสตร์เท่านั้นที่จะเข้าใจ มันแบ่งข้อมูลเช่นปริมาณดีเอ็นเอสายพันธุ์ที่พบในแต่ละ 38 โครโมโซมทั้งหมดในชุดของกราฟที่มีสีสัน เลื่อนลงเพื่อดูข้อมูลเกี่ยวกับความหลากหลายทางพันธุกรรมของสุนัขซึ่งเป็นการวัดจริงของการผสมพันธุ์ (ความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับพ่อแม่ของสุนัข) ยิ่งมีการผสมพันธุ์มากขึ้นเท่าไหร่ก็ยิ่งสามารถสืบทอดเงื่อนไขทางพันธุกรรมได้มากขึ้นเท่านั้น แมดิสันผู้ปกครองของ mutt มีค่าสัมประสิทธิ์การผสมพันธุ์ 0 เปอร์เซ็นต์; แต่พ่อแม่ของกริฟฟินพันธุ์แท้มีร้อยละ 23 ของสัดส่วนของยีนที่เหมือนกันทั้งพ่อและแม่

หากคุณเป็นคนที่ชอบอ่านจีโนม Embark ให้คุณดาวน์โหลดไฟล์ ZIP ที่มีข้อมูลที่ไม่ถูกตีความประมาณ 7 เมกะไบต์ของตัวทำเครื่องหมาย 200, 000 ตัวในกลุ่มตัวอย่าง คุณจะทำอะไรกับสิ่งนั้น

รายงานลักษณะค่อนข้างน่าสนใจโดยแสดงตำแหน่งทางพันธุกรรมที่ส่งผลต่อสีและเสื้อโค้ต มันเป็นภาระอีกครั้งกับการพูดคุยเกี่ยวกับโครโมโซมและการเชื่อมโยงไปยังสุนัขตัวอื่น ๆ ที่มีการค้นพบที่คล้ายกัน ข้อยกเว้นคือส่วนค่าสัมประสิทธิ์การแพร่กระจายซึ่งแสดงให้เห็นว่าแม่และพ่อพันธุ์แท้ของสุนัขสายพันธุ์เดียวกันมียีนร่วมกันเท่าใด พ่อแม่ของกริฟฟินมีผล 23 เปอร์เซ็นต์ (แมดิสันเป็นคนโง่: 0 เปอร์เซ็นต์) เป็นที่น่าสนใจที่จะเห็น "เดซี่" ปรากฏว่ามีจีโนไทป์เช่นเดียวกับเมดิสันเช่นกัน แต่ในระยะยาวส่วนคุณลักษณะของแผงควบคุมของ Wisdom Panel นั้นดีกว่าสำหรับผู้ใช้ทั่วไปมากกว่าข้อมูลที่ซับซ้อนกว่าของ Embark

บทสรุปทางพันธุกรรม

เริ่มดำเนินการเป็นเรื่องจริง หากคุณกังวลเกี่ยวกับปัญหาสุขภาพทางพันธุกรรมที่อาจเกิดขึ้นกับสุนัขของคุณชุดนี้ควรเป็นตัวเลือกแรกของคุณ มันเพียงทดสอบปัญหาเพิ่มเติม สำหรับสิ่งนั้นเพียงอย่างเดียวมันคุ้มค่าที่ $ 50 มากกว่าราคาของ Wisdom Panel ในผลลัพธ์ของเราการกำหนดสายพันธุ์ส่วนใหญ่จะสอดคล้องกัน ด้วยพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ที่ บริษัท มีจึงมีเหตุผลน้อยมากที่จะรู้สึกน้อยกว่าความมั่นใจในผลลัพธ์ของมัน ที่กล่าวว่าข้อมูลจำนวนมากที่นำเสนอนั้นไม่จำเป็นและซับซ้อนสำหรับเจ้าของสุนัขโดยเฉลี่ย